許多甲狀腺疾病的發生率與性別有明顯關係，以女性居多。1941年在新竹的研究顯示，地方性甲狀腺腫尖峰分佈男在11-15歲，女在26-30歲，過了尖峰期，發生率明顯降低，男性28.5％降至3％，女性由44.9％降至25％。在1993-1994，對1020位成年健檢受檢者的調查亦顯示，甲狀腺腫發生率，女比男高（33.6％比19.4％）。在甲狀腺囊腫，1988年的研究，65位病人中，男性13位，女性52位，為1：4。
至於在自體免疫性甲狀腺疾病方面，女性和男性的發生更有明顯的差別。106位從1980至1987年，確診為自體免疫性甲狀腺炎的病例顯示，男性只有4位，女性有102位，也就是1比25.5。而在葛瑞夫茲氏病方面，我們最近收集1024位病人，包括男性176位，女性848位（男女比為1比4.8），與我們過去連續收集55位甲狀腺機能亢進之葛瑞夫茲氏病人，男性11位，女性44位（1比4）近似。
至於在甲狀腺癌，1987-1992收集的47位做過超音波，手術證實為乳突癌的病人，其中男性11位，女性36位，男比女為1比3.3。在甲狀腺髓質癌，1977-2000收集的54位病人，男性24位，女性30位，差別就比較不大（1比1.25）。至於未分化癌，1980-1988的24位病例，男性10位，女性14位，為1：1.4，差別亦不是很明顯。
為何很多甲狀腺疾病，女性皆比男性發生率多很多呢？有一個可能是甲狀腺細胞有動情素受器，因此會受到動情素的刺激，這可由小學甲狀腺腫的盛行率調查，在5、6年級，也就是11歲，12歲，開始動情素分泌時，女性甲狀腺腫發生率明顯增加，且高於男性學童得到證實。至於自體免疫性甲狀腺疾病，由於女性比較容易發生自體免疫性疾病，因此女、男之比也就明顯拉開，特別是自體免疫性甲狀腺炎。而在甲狀腺乳突癌，由於細胞來自甲狀腺，因此女男之比也明顯有差別，但髓質癌則因不是甲狀腺濾泡細胞，而是神經內分泌C細胞，因此差別不大。但未分化癌則無法解釋。
總之，性別對甲狀腺疾病的發生率有明顯的影響，大部分以女性居多。
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