大部分肝癌在診斷時因為腫瘤大小、數量、位置及肝功能的緣故，無法接受手術或其他可以根除腫瘤的治療。對於這些病患，肝臟移植就成為根除肝癌最重要的方法，它最大的優點是可以將肝臟內的腫瘤根除，同時將原本罹患疾病而且硬化的肝臟移除，但是移植手術的風險較高。移植後部分的腫瘤仍然可能復發，加上器官的來源有限，手術後必須長期服用抗排斥藥等因素，使得肝臟移植在肝癌治療上的角色仍需進一步探討。

肝癌的數量、大小，是否有血管及周圍器官的侵犯，腫瘤分化的程度，胎兒蛋白的血中濃度以及肝癌的分布等因素，都與移植後的肝癌復發有關，為了避免讓復發可能性太高的病人接受肝臟移植，目前國內仍然以UCSF準則作為選擇病人是否適合接受肝移植的標準。

目前國內腦死捐贈肝臟者的數量，遠不及需要肝臟移植的病患人數，病人等候肝臟移植的時間往往長達一年以上。即使有適合的活體捐贈者，從徵詢捐贈者同意、安排檢查到實際進行移植，也必須耗費一些時日。這段期間內，等候移植的病患仍然必須接受其他治療以控制腫瘤的生長。移植前的局部治療，提供了一個觀察腫瘤生物行為的機會，但是對於減少肝癌復發是否有實際幫助，則尚待釐清。

接受肝臟移植以後必須接受免疫抑制劑的治療，以避免發生排斥，部份抗排斥藥物可能對肝癌的復發產生影響。曾有報告指出，環孢靈濃度的高低會影響肝炎復發的比例，在實驗室中普樂可複可以抑制分化較差的肝癌細胞的繁殖，然而怎樣的抗排斥藥組合和其劑量多寡最適當仍需更多研究。

為了避免肝癌復發，許多研究是在肝臟移植手術後附加化學治療，希望降低腫瘤的復發率，但目前並沒有顯著的證據證明其療效。化學治療所帶來的併發症，包括增加B-型肝炎復發，使得我們在運用及調節這些藥物上，必須更加謹慎。

目前肝臟移植已廣泛用於治療無法手術切除的早期肝癌，未來如果可以在移植前、後附加其他治療減少腫瘤復發；減少抗排斥藥所帶來的副作用並增加器官的來源，將可以使更多肝癌病患獲得根治的機會。