外科手術用於治療重度肥胖病人已有超過50年的歷史，近年來許多學者注意到減重手術不但可以有效減重，對治療因肥胖引起的代謝症候群及第二型糖尿病更有絕佳的效果。針對手術治療糖尿病的近年許多研究發現腸道荷爾蒙不但與胰島素的分泌有關，第二型糖尿病的形成更可能與腸道荷爾蒙失調有關。一些動物實驗也支持十二指腸周圍有分泌一種促糖尿病產生的物質，因此糖尿病病人如果可以將十二指腸隔離應該有助於糖尿病的治療。相反的小腸末端則由食物的刺激可產生GLP-1，刺激胰島素的產生，可以用來治療糖尿病。因此目前認為外科手術治療糖胖症的機轉有四，第一是飲食限制再跟隨體重下降的效果，第二是Ghrelin的效果，第三是十二指腸(上腸道)隔絕的效果，第四是下腸道荷爾蒙刺激的效果
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目前非侵襲性手術治療有胃內水球、十二指腸及空腸袖狀管等。侵襲性手術治療則有腹腔鏡可調節胃束帶手術、胃縮小手術以及胃繞道手術等。治療效果與病人的配合度、手術複雜度有關，臨床醫師可針對病人情形而採用最適宜的治療方法。
