自從諾貝爾醫學獎得主Thomas於1959年首先報告在一末期血癌病人施行同卵雙胞胎骨髓移植以來，直到1968年才有在小孩子的免疫不全病人以異體骨髓移植成功之病例，在這四、五十年來造血幹細胞移植之發展相當快速，這主要歸功於對病人支持性照護之改善，感染症治療及HLA配對之進步，因此在早期利用於治療一些非癌症的病人，而對於癌症之治療，則只局限於末期癌症之病人，而在1977年時Thomas曾報告以HLA相配合的異體骨髓移植來治療末期血癌病人而得到痊癒的報告，直到1980年代則有更多利用自體及異體造血幹細胞移植於惡性病病人之治療，此時已可達到在急性骨髓性白血病病人於初次緩解時即進行骨髓移植有一半以上的病人可得到痊癒。同時由於cyclosporin之使用，對於GVHD之發生有了個更好的預防方法。由於家族中兄弟姊妹間無HLA相合的捐髓者時，開始有使用HLA相合的非親屬間的移植，因此國內外有了骨髓捐贈資料庫之成立，而從1990年代開始有使用末稍造血幹細胞，臍帶血幹細胞及HLA不相合的親屬間移植了，同時開始使用移植前降低前處置劑量，即所謂非骨髓殲滅性之移植，使得一些年紀大及有較高危險性的病人也可以進行造血幹細胞移植，在這一段時間內慢性骨髓性白血病一直佔著異體移植的最大比例，直到2000年代由於TKI的使用，使得慢性骨髓性白血病病人的骨髓移植量急速下降，取而代之的是自體幹細胞移植在多發性骨髓瘤病人的應用。雖然到目前，造血幹細胞移植在血液疾病及一些先天遺傳性疾病之治療已是一種不可或缺的治療方法，但是成功率仍無法達到完全令人滿意之地步，當然感染症之發生是其失敗中一大主因，幸好目前對於感染症之治療已有相當多種藥物的選擇，這對接受骨髓移植的病人實是一大福音。