我國自70年代起即由疾管署陸續實施肝炎防治計畫，99年衛福部肝癌及肝炎防治會決議，由健康署、疾管署及健保署等相關權責單位，一併研議「肝病十年減半」之中長程計畫，從預防、篩檢到治療各司其職，本署主要負責B、C型肝炎篩檢、肝癌防治及協助相關健康識能之提升。為因應環境變遷、符合國際趨勢及防治肝癌之長期目標，健保署正研提國家級C型肝炎防治計畫，健康署也負責綜整病毒性肝炎防治第二期計畫。
　　過去十年來，我國慢性肝病、肝硬化及肝癌死亡率雖持續下降，但在國際間仍屬高發生率及死亡率的國家，每年造成約1.3萬名病患死亡。C型肝炎主要透過血液傳染，在臺灣部份感染者因接受汙染之血液製劑、移植器官或因受汙染的注射針具而感染，據楊培銘(2007)年推估目前30歲以上國人約有55萬C型肝炎感染者。另分析我國癌症登記資料及高雄長庚資料皆顯示，肝癌患者中有C型肝炎的比例約在40%。
　　為協助防治B、C型肝炎及肝癌，健康署前於99年12月召開專家會議，決議訂定B、C型肝炎篩檢資格條件，並於隔年納入成人預防保健服務。另分析國人B、C型肝炎認知、接受篩檢及後續追蹤治療意願之現況及變化趨勢，每年定期辦理「健康危害行為監測調查」，並配合世界肝炎日，應用多元傳播媒介，呼籲國人了解肝病的主因、了解自身感染狀況，推廣「肝病有藥醫」，使肝炎感染者都能接受治療。
　　為使肝癌患者接受有品質治療，民國93-95年發展肝癌診療核心測量指標，96到102年極早期和早期肝癌病人接受治癒性療法的比率從58.4%提升到82.1%；若是肝癌進展到末期，尊重病人意願、提供症狀治療以減輕病人痛苦，維護病人生命尊嚴，是安寧療護最重要的工作，2012年超過一半的癌症病人病逝前一年利用安寧照護，度過人生最後一段安適而有品質的生活，陪伴家屬度過哀傷，讓生死兩無憾。我國雖發生及死亡率皆為較高之國家，但肝癌死亡發生率比(MR/IR)低於7成，是OECD國家中最低的，顯示我國肝癌治療照護漸臻於完善。
　　未來將順應WHO建議之病毒性肝炎防治策略，研提第二期病毒性肝炎防治計畫，以期2030年時，病毒性肝炎不再是主要的公共衛生威脅，且所有病毒性肝炎患者都能獲得安全、可負擔和有效的預防、照護和治療。