由於質子治療，可以減少對正常組織不必要的損傷。因此，越來越多癌症患者需要質子治療。特別是對於兒童癌症患者，尤為受到重視。
　　然而，在兒童質子治療的許多挑戰中，麻醉是非常挑戰的部分之一。其實質子治療過程不會引起疼痛，不需要麻醉來止痛。但是，要求兒童自己一個人，在放射治療室中躺著約30至90分鐘，是很不容易達成的事。為了讓年幼的兒童，也可以進行質子治療，通常需要麻醉或鎮靜，以確保在放射治療期間完全固定患者。
　　兒童質子治療麻醉，需要一群訓練有素的麻醉醫師，提供必要的照顧和設備。無論從麻醉誘導，到治療結束和進行恢復，可使患者安全的完成治療。根據統計資料，兒童質子治療中，3歲（含）以下兒童幾乎都需要麻醉。而7歲以後的兒童，僅約半數需要麻醉。因此，隨著需要麻醉的情況增加，醫療成本就會增加，這是目前台灣的健保政策需要努力的部分。